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含400個(gè)不同物種及24種腸道微生物“暗物種”

腸道微生物與宿主健康和生長(zhǎng)發(fā)育密切相關(guān)。中國(guó)科學(xué)院微生物研究所供圖

（記者馮麗妃）近日，中國(guó)科學(xué)院微生物所研究員劉雙江團(tuán)隊(duì)構(gòu)建了包含400個(gè)不同物種的健康人群腸道微生物菌株資源庫(kù)（hGMB）。相關(guān)成果發(fā)表于《微生物組》。

此次構(gòu)建的hGMB包括400個(gè)不同的物種，其中有102個(gè)物種為首次分離、培養(yǎng)和鑒定，1170株代表性菌株保存在中國(guó)普通微生物菌種保藏中心，已經(jīng)向科研界和產(chǎn)業(yè)界提供了數(shù)次菌株服務(wù)，支持腸道微生物功能開發(fā)和微生物—宿主互作研究。為了充分發(fā)揮和挖掘菌株資源的價(jià)值，該資源庫(kù)物種信息已在相關(guān)網(wǎng)站公布。

據(jù)介紹，hGMB的構(gòu)建歷時(shí)兩年，研究團(tuán)隊(duì)從239例來自不同地區(qū)、不同年齡體檢健康人群的新鮮糞便樣品中挑取超過2萬個(gè)單克隆，擴(kuò)大培養(yǎng)后從中鑒定出超過1萬個(gè)純培養(yǎng)分離株。通過對(duì)健康人腸道宏基因組分析，發(fā)現(xiàn)該菌株資源庫(kù)中的85個(gè)新物種出現(xiàn)在超過90%健康人腸道中，同時(shí)覆蓋79%人腸道已知常見屬和75%常見物種。

與目前最大的人腸道基因組數(shù)據(jù)庫(kù)（UHGG）對(duì)比，hGMB貢獻(xiàn)了24個(gè)在腸道免培養(yǎng)組學(xué)研究中未被探測(cè)到卻普遍存在的“暗物種”。

作者表示，鑒于腸道微生物菌株資源庫(kù)的建設(shè)是開發(fā)利用腸道微生物的基礎(chǔ)，是認(rèn)知宿主—微生物互作機(jī)制中至關(guān)重要的一環(huán)，構(gòu)建中華腸道微生物資源庫(kù)具有長(zhǎng)遠(yuǎn)的戰(zhàn)略意義和經(jīng)濟(jì)社會(huì)價(jià)值。

去年，該團(tuán)隊(duì)還發(fā)表了迄今為止最大的模式動(dòng)物小鼠腸道微生物資源庫(kù)（mGMB），包含126種微生物及其基因組，其中77種微生物是首次成功分離培養(yǎng)的新物種，使得可培養(yǎng)的小鼠腸道微生物菌株資源從48個(gè)屬增加到110個(gè)屬、從76種增加到180種，且在此過程中形成了一套厭氧微生物分離培養(yǎng)與物種鑒定描述的標(biāo)準(zhǔn)化流程。