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近日，一項(xiàng)對(duì)近12000篇人類遺傳學(xué)論文的計(jì)算機(jī)輔助分析發(fā)現(xiàn)，其中700多個(gè)研究包含的DNA或RNA序列存在錯(cuò)誤。該研究負(fù)責(zé)人、澳大利亞悉尼大學(xué)癌癥專家Jennifer Byrne認(rèn)為，這一比例值得警醒，表明人類基因組研究中的一部分是不可靠的。

也許上述這些錯(cuò)誤是偶然出現(xiàn)的，但研究人員懷疑，也有可能存在學(xué)術(shù)欺詐。

2015年以來(lái)，Byrne一直在尋找遺傳學(xué)研究中的錯(cuò)誤。此前，她在5篇涉及一項(xiàng)常見(jiàn)實(shí)驗(yàn)（使用一小段DNA使癌細(xì)胞中的基因失活）的論文中發(fā)現(xiàn)了問(wèn)題——實(shí)驗(yàn)所用的核苷酸序列是錯(cuò)誤的。此外，它們還使用了相似的語(yǔ)言表達(dá)和數(shù)據(jù)。Byrne懷疑它們出自一家“論文工廠”，即由第三方公司根據(jù)“訂單”提供論文。

目前，這5篇論文中的4篇論文已經(jīng)被撤回。隨后，Byrne繼續(xù)尋找存在類似問(wèn)題的論文。

2017年，Byrne與法國(guó)格勒諾布爾大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)家Cyril Labb合作，創(chuàng)建了名為Seek &Blastn的軟件，它能夠識(shí)別出研究中潛在的錯(cuò)誤。

例如，該軟件可以從論文中提取短核苷酸序列，并將其與開放核苷酸數(shù)據(jù)庫(kù)Blastn中的數(shù)據(jù)進(jìn)行比較，以檢查它們是否與研究預(yù)期的人類基因組相匹配。然后，研究人員會(huì)手動(dòng)檢查每個(gè)被標(biāo)記出的不匹配的地方。

研究小組利用該軟件對(duì)《基因》和《腫瘤學(xué)報(bào)告》（這兩本期刊此前發(fā)表過(guò)有問(wèn)題的論文）上的相關(guān)論文進(jìn)行了篩選，包括2007年至2018年發(fā)表于《基因》的7400篇原始論文，以及2014年至2018年發(fā)表于《腫瘤學(xué)報(bào)告》的3800篇開放獲取論文。

經(jīng)過(guò)人工檢查，研究人員發(fā)現(xiàn)《腫瘤學(xué)報(bào)告》論文中約有12%的核苷酸序列存在問(wèn)題，《基因》論文中存在上述問(wèn)題的只有2%。此外，Byrne帶領(lǐng)研究小組還對(duì)此前出現(xiàn)過(guò)問(wèn)題的癌癥遺傳學(xué)亞領(lǐng)域的研究論文進(jìn)行了篩查，結(jié)果發(fā)現(xiàn)，在約600篇相關(guān)論文中，超過(guò)25%的論文核苷酸序列存在錯(cuò)誤。

相關(guān)論文近日發(fā)布在預(yù)印本平臺(tái)bioRxiv上。研究人員表示，他們發(fā)現(xiàn)的核苷酸序列存在錯(cuò)誤的論文比例高得令人無(wú)法接受。他們已經(jīng)給所有能夠找到編輯聯(lián)系方式的相關(guān)期刊或出版商發(fā)送了電子郵件，其中一些回復(fù)說(shuō)將對(duì)這些存在問(wèn)題的論文進(jìn)行調(diào)查。（徐銳）