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更多>光明網(wǎng)訊(記者 宋雅娟 張蕃) 中國李是世界上商業(yè)化栽培最廣泛的李種之一,適應(yīng)性強(qiáng),具有較高的經(jīng)濟(jì)價值與生態(tài)價值。近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所李杏種質(zhì)改良團(tuán)隊與桃種質(zhì)資源團(tuán)隊聯(lián)合破譯了中國李高質(zhì)量基因組,為其重要經(jīng)濟(jì)性狀改良奠定遺傳學(xué)基礎(chǔ),相關(guān)成果9月2日發(fā)表于《植物學(xué)雜志(The Plant Journal)》。
據(jù)黃振宇博士介紹,研究團(tuán)隊首先利用二代、三代及Hi-C等測序技術(shù)繪制了李杏種質(zhì)改良團(tuán)隊自主選育品種‘中李6號’基因組圖譜,其組裝質(zhì)量為現(xiàn)有最優(yōu),為深度解析中國李基因組變異規(guī)律、分子育種及優(yōu)異基因發(fā)掘奠定了重要基礎(chǔ)。
基因組注釋示意圖:Ⅰ~Ⅴ分別表示染色體長度,基因密度,重復(fù)序列密度,GC堿基含量以及基因組內(nèi)部共線性關(guān)系
在此基礎(chǔ)上,該研究又進(jìn)行了全基因組高深度重測序數(shù)據(jù)分析,共鑒定到3,380,659個高質(zhì)量SNPs,將74份中國李核心種質(zhì)聚類為南、北、東北及國外品種群,發(fā)現(xiàn)南方品種群較為原始,遺傳多樣性豐富,且與其他品種群間存在基因交流,從遺傳學(xué)層面再次證實我國長江流域為中國李原始馴化中心。
中國李適應(yīng)性極強(qiáng),在我國南至廣東省、北至黑龍江省,均有大面積栽培,但關(guān)于其適應(yīng)性機(jī)制鮮有報道。研究對不同品種群間進(jìn)行選擇壓分析,共鑒定到35個受選擇位點(diǎn),其中,開花調(diào)控、抗病抗逆及類黃酮代謝等重要途徑關(guān)鍵基因顯著富集,此外,基因家族的擴(kuò)張和收縮分析表明,以上幾類基因家族在基因組進(jìn)化過程中顯著擴(kuò)張,初步揭示了中國李重要性狀馴化的分子基礎(chǔ),為后續(xù)發(fā)掘中國李適應(yīng)性相關(guān)優(yōu)異基因提供重要參考。
據(jù)了解,該研究得到國家重點(diǎn)研發(fā)計劃、中國農(nóng)科院科技創(chuàng)新工程等項目的資助。
[ 責(zé)編:武玥彤]要聞
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