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相關(guān)論文于2021年2月23日在線發(fā)表在專業(yè)期刊《Genome Medicine》雜志。
新冠病毒致病性強(qiáng),人間傳播快,闡明新冠病毒的變異特征對(duì)疫情防控、病原檢測(cè)、疫苗開發(fā)等具有重要意義。
上述研究采集了新冠肺炎患者連續(xù)時(shí)間點(diǎn)、多種類型樣品,包括:鼻咽拭子、痰液、糞便、尿液、胃粘膜等,利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和探針雜交捕獲法同時(shí)進(jìn)行新冠病毒基因組深度測(cè)序,比較分析不同個(gè)體間和個(gè)體內(nèi)不同組織中的病毒進(jìn)化變異特征。
研究發(fā)現(xiàn)臨床樣品深度測(cè)序病毒相關(guān)序列比例與熒光定量CT值具有一定相關(guān)性,其中呼吸道(鼻、咽、痰)和腸道樣品(糞便、肛拭子)檢測(cè)到的病毒相關(guān)序列遠(yuǎn)高于尿液和胃粘膜樣品。另外,研究發(fā)現(xiàn)在新冠肺炎患者腸道樣品中存在多個(gè)不同分支病毒共同存在的現(xiàn)象,可能來自于多個(gè)亞型共感染、反復(fù)突變或準(zhǔn)種變化等原因。
此外,研究團(tuán)隊(duì)比較分析發(fā)現(xiàn)腸道樣品新冠病毒的多樣性高于呼吸道樣品,腸道樣品中新冠病毒變異更加穩(wěn)定、變異多樣性更豐富、個(gè)體少數(shù)堿基突變也更具有可持續(xù)性。
研究團(tuán)隊(duì)相關(guān)負(fù)責(zé)人表示,“腸道樣品是否更容易產(chǎn)生變異毒株”是未來一個(gè)重要研究方向,最終需要更多研究明確與否。
據(jù)介紹,廣州醫(yī)科大學(xué)呼吸疾病國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主要研究領(lǐng)域瞄準(zhǔn)呼吸系統(tǒng)疾病的臨床與基礎(chǔ)研究:突發(fā)性重大呼吸系統(tǒng)傳染病與肺損傷、支氣管哮喘與慢性咳嗽、慢性阻塞性肺疾病、肺癌等。創(chuàng)始主任為中國工程院院士鐘南山。(蔡敏婕)
[ 責(zé)編:張蕃]標(biāo)簽: 科研 發(fā)現(xiàn) 腸道 樣品
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