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動(dòng)物全物種基因組測(cè)序“顧此失彼”

2021-12-08 11:09:44 來(lái)源:中國(guó)科學(xué)報(bào)

近日,美國(guó)華盛頓州立大學(xué)領(lǐng)導(dǎo)的一項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn),目前對(duì)動(dòng)物基因組進(jìn)行的測(cè)序多數(shù)集中在與人類相似的動(dòng)物上。研究人員警告稱,這會(huì)使人們忽視生物多樣性和錯(cuò)失機(jī)會(huì)。相關(guān)成果發(fā)表于美國(guó)《國(guó)家科學(xué)院院刊》。

研究人員分析發(fā)現(xiàn),近3300種動(dòng)物的基因組已被測(cè)序。然而,與世界上166萬(wàn)種動(dòng)物物種相比,這一數(shù)字還是很少,脊椎動(dòng)物在目前的序列中占了絕大部分。數(shù)據(jù)顯示,盡管脊椎動(dòng)物只代表了3.9%的動(dòng)物物種,但卻占測(cè)序數(shù)據(jù)集的54%。相比之下,代表78.5%物種的節(jié)肢動(dòng)物門無(wú)脊椎動(dòng)物,只占當(dāng)前數(shù)據(jù)集的34%。

“隨著基因組數(shù)據(jù)集的迅速積累,我們會(huì)發(fā)現(xiàn),目前數(shù)據(jù)集并不是均勻分布在動(dòng)物生命樹(shù)中。”研究作者、華盛頓州立大學(xué)博士后研究員Scott Hotaling認(rèn)為,無(wú)脊椎動(dòng)物仍然非常缺乏相關(guān)研究,因?yàn)槿藗兯坪醺P(guān)心脊椎動(dòng)物。

研究通訊作者、美國(guó)楊百翰大學(xué)助理教授Paul Frandsen表示,要了解整個(gè)生態(tài)系統(tǒng),必須對(duì)更多的生物進(jìn)行采樣。脊椎動(dòng)物是生態(tài)系統(tǒng)的重要組成部分,但昆蟲和許多其他小型生物可能發(fā)揮著更重要的作用,因?yàn)樗鼈兲幱谑澄镦湹牡锥恕?/p>

研究作者、華盛頓州立大學(xué)副教授Joanna Kelley還指出,目前絕大多數(shù)基因測(cè)序工作在發(fā)達(dá)國(guó)家開(kāi)展,且大多數(shù)國(guó)家位于北半球,不同地區(qū)的測(cè)序工作也有特定的傾向。例如,北美國(guó)家對(duì)哺乳動(dòng)物和昆蟲進(jìn)行了較多測(cè)序,歐洲國(guó)家、亞洲國(guó)家分別對(duì)魚類和鳥(niǎo)類進(jìn)行了較多測(cè)序。

近年來(lái),幾項(xiàng)大型的基因組測(cè)序工作啟動(dòng),其中包括地球生物基因組計(jì)劃。該計(jì)劃設(shè)定了一個(gè)雄心勃勃的目標(biāo),在未來(lái)10年內(nèi)對(duì)所有真核生物進(jìn)行測(cè)序。

截至2021年6月,該計(jì)劃已收集到3300多個(gè)動(dòng)物基因組數(shù)據(jù)集。研究人員通過(guò)計(jì)算發(fā)現(xiàn),以目前每天大約測(cè)序4個(gè)基因組的速度,要到3130年才能實(shí)現(xiàn)對(duì)所有真核生物進(jìn)行測(cè)序的目標(biāo)。

研究人員同時(shí)提出,促進(jìn)該目標(biāo)實(shí)現(xiàn)的一個(gè)方法是發(fā)展基礎(chǔ)設(shè)施,并讓更多來(lái)自南半球的國(guó)家,尤其是動(dòng)物多樣性豐富的熱帶地區(qū)的研究人員參與其中。(辛雨)

相關(guān)論文信息:

https://doi.org/10.1073/pnas.2109019118

標(biāo)簽: 基因組測(cè)序 生物多樣性